فهرست مطلبها
عنوان صفحه
دوران اول:کلیات تحقیق........................................................................................................ 1
1-1- ویروس موزائیک توتون...............................................................................................1
1-2- خصوصیات فیزیکی ویروس........................................................................................2
1-3- اهمیت ویروس موزائیک توتون....................................................................................2
1-4- اهداف مطالعه...................................................................................................... .......4
دوران دوم: مبانی نظری و پیشینه تحقیق
2-2-جزئیات ویروس (خصوصیات فیزیکی)
2-6-همانندسازی (رونوشت ویروس در سلول میزبان)
2-7-ساختار ژنوم و ORF ها و نواحی جز رنج شونده
2-7-1- عملکرد پروتئینهای ویروس
2-7-1-2- پروتئین 126 و 183 کیلو دالتون
2-9- کارهای انجام شده در خصوص ویروس موزائیک توتون
3-2-1- دستورالعمل 1: مراحل استخراج RNA از بافت گیاه با استفاده از کیت
3-4- آنالیز بیوانفورماتیک و طراحی آغازگرها
3-4-1- بازیابی توالی ژنوم ویروس موزائیک توتون
3-4-2- همردیفی جدایه های مختلف ویروس به منظور طراحی آغازگرها
3-5- بهینه سازی تکثیر پاره کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون با استفاده از آغازگرهای اختصاصی مختلف..................................................................................................... ......
3-5-2- واکنشNested PCR حرف آغازگرهای (PSh60F/PSh60R2) حرف استفاده از DNA تکثیر شده باکیتLong
3-5-3- واکنش Long PCR با آغازگرهای (PSh60F/PSh60R) با استفاده ازcDNA اولیه و خالص سازی آن از روی ژل
3-7- خالص سازی و توالی یابی قطعه تکثیر شده
3-7-1- آییننامه 2: : خالص سازی از روی ژل حرف استفاده از کیت کیاژن
3-8-2- آنالیز توالی آمینواسیدی پروتئین حرکتی TMV-ir باب مقایسه با تاخت نژاد TMV-U1 و TMV-Ohio V
3-8-4- آنالیز توالی نوکلئوتیدی کد کننده پروتئین پوششی در مقایسه حرف 12 جدایه در بانک ژن NCBI
3-8-5- آنالیز توالی آمینواسیدی پروتئین پوششی در تشبیه با پروتئین پوششی 5 جدایه اعلام شده از ایران
3-8-6- آنالیز کل توالی تعیین ترتب شده TMV-ir حایز پروتین حرکتی و پوششی ویروس با دیگر توالی ها
3-8-6-1- تعیین قرابت ژنتیکی قطعه تعیین ترادف شده در مقایسه با 12 جدایه درج شده در بانک ژن
4-1-آنالیز بیوانفورماتیک و طراحی آغازگرها
4-1-1-بازیابی و تشریح توالی ژنوم ویروس موزائیک توتون
4-1-2-همردیفی جدایه های مختلف ویروس و آنالیز فیلوژنتیکی
4-2- بهینه سازی تکثیر قطعه کامل ژنوم ویروس موزائیک توتون با استعمال از آغازگرهای اختصاصی مختلف
4-2-1- واکنش زنجیره ای پلیمراز (PCR) حرف استعمال از cDNA ساخته شده و آغازگرهای PSh60 F/R
4-2-2-واکنشNested PCR با آغازگرهای (PSh60F/PSh60R2) با استفاده از DNA تکثیر شده با